Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tspan4Q9DCK3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tspan4Q9DCK3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan4Q9DCK3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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