Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xab2Q9DCD2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms