Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Swt1Q9DBQ9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms