Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkar1aQ9DBC7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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