Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tysnd1Q9DBA6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tysnd1Q9DBA6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tysnd1Q9DBA6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms