Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Smg9Q9DB90 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Smg9Q9DB90 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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