Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Med27Q9DB40 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms