Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms