Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smco2Q9DA21 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smco2Q9DA21 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms