Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgf29Q9DA08 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms