Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efhc1Q9D9T8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms