Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D9H8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D9H8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms