Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4bQ9D9F7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms