Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmco5aQ9D9D5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms