Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg7Q9D906 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms