Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms