Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgap3Q9D8S3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms