Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alkbh4Q9D8F1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms