Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Jam3Q9D8B7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms