Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisa5Q9D7I0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms