Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Borcs8Q9D6Y4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Borcs8Q9D6Y4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Borcs8Q9D6Y4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Borcs8Q9D6Y4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms