Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Rab11fip1Q9D620 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rab11fip1Q9D620 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab11fip1Q9D620 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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