Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lpcat2bQ9D5U0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms