Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms