Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhd1Q9D4J1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms