Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms