Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
4933428G20RikQ9D3X4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
4933428G20RikQ9D3X4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms