Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4933428M09RikQ9D3X3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms