Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx29Q9D3S3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms