Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Katnal2Q9D3R6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Katnal2Q9D3R6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms