Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy3Q9D394 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms