Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l4Q9D2A5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms