Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms