Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D1K7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms