Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl53Q9D1H8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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