Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ube2cQ9D1C1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ube2cQ9D1C1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2cQ9D1C1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ube2cQ9D1C1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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