Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms