Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syf2Q9D198 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms