Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms