Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CenpnQ9CZW2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CenpnQ9CZW2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CenpnQ9CZW2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CenpnQ9CZW2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CenpnQ9CZW2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CenpnQ9CZW2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms