Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp11Q9CZJ1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms