Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp8Q9CY28 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gtpbp8Q9CY28 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gtpbp8Q9CY28 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp8Q9CY28 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms