Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms