Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SdhdQ9CXV1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SdhdQ9CXV1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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