Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms