Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CXL3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CXL3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms