Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrc17Q9CXD9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc17Q9CXD9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms