Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdca4Q9CWM2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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