Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms