Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn3Q9CVD2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms